MicroRNA or Not MicroRNA?

نویسندگان

  • David Langenberger
  • Sebastian Bartschat
  • Jana Hertel
  • Steve Hoffmann
  • Hakim Tafer
  • Peter F. Stadler
چکیده

The avalanche of next generation sequencing data has led to a rapid increase of annotated microRNAs in the last few years. Many of them are specific to individual species or rather narrow clades. A closer inspection of the current version of miRBase shows that dozens of entries conflict with other ncRNAs, in particular snoRNAs. With few exceptions, these cases show little similarities to canonical microRNAs, however, and thus they should be considered as mis-annotations.

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Evaluation of Extracellular Circulating Human MicroRNA-197 as a Target Biomarker in Patients with Coronary Artery Disease

Background:  Coronary Artery Disease (CAD) refers to the reduction or blockage of all or part of the coronary arteries due to the process of atherosclerosis or the presence of a clot. The aim of this study was to investigate the association of serum miR-197 as a diagnostic index in patients with coronary artery disease. Methods: In this study, 100 patients with CAD were selected. Extraction of...

متن کامل

Effects of genistein and swimming exercise on spatial memory and expression of microRNA 132, BDNF, and IGF-1 genes in the hippocampus of ovariectomized rats

Objective(s): The aim of the present study was to investigate the effects of genistein and exercise on the spatial memory and expression of microRNA-132, BDNF, and IGF-1 in the hippocampus of ovariectomized rats. Materials and Methods: Sixty animals were divided into six groups of control, sham, ovariectomy (OVX), ovariectomized with 8 weeks of genistein administration (OVX.G), with 8 weeks of ...

متن کامل

افزایش بیان اختصاصی ژن Cdk9 بوسیله microRNA-1 بالغ تک رشته در سلول های فیبروبلاست

Abstract Background: MicroRNAs (miRNAs) are endogenous, non-coding short RNAs (~22 nt) that can downregulate gene expression by translational repression, mRNA degradation, or transcriptional repression. miRNA misregulation has been implicated in pathogenic alterations such as cancer. In order to investigate microRNA functions in gene regulation and/or to modulate their expression in pathogenic...

متن کامل

P-244: Analysis of Genomic and Cell Free DNA of A let-7 microRNA Binding Site of KRAS Gene Polymorphisms in Endometriosis

Background: Endometriosis is one of the most common benign gynecological diseases which is characterized by endometriallike tissue growing outside the uterine cavity. Although the pathology of endometriosis remains unknown, the genetic predisposition plays an apparent role. Several genes have been contributed to endometriosis, but it seems KRAS has a crucial role, because its activation results...

متن کامل

یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری

زمینه و هدف: سرطان پروستات ازجمله سرطان‌های شایع میان مردان است که ناهمگونی بسیار بالایی را در ویژگی‌های ژنتیکی و پاتولوژیکی از خود نشان می‌دهد. توضیح روابط تنظیمی بین mRNA و microRNA می‌تواند به شناسایی الگوی تنظیم بیان ژن در سرطان پروستات بدخیم کمک کند. در این مطالعه یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری بررسی گردید. روش...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

عنوان ژورنال:

دوره   شماره 

صفحات  -

تاریخ انتشار 2011